SURFSeq 5000為(wèi)用(yòng)户提供Balanced Mode(BM,均衡模式)和Enhanced Mode(EM,增强模式)两大Q40测序模式。
• 在Balanced Mode下，SURFSeq 5000可(kě)实现≥90% bases≥Q30，≥85% bases≥Q40。
• 在Enhanced Mode下，SURFSeq 5000可(kě)实现≥95% bases≥Q30，≥90% bases≥Q40。
*Q30/Q40%基于真迈⽣物(wù)企业标准品文(wén)库多(duō)轮测试结果的中(zhōng)位数值设定，该数值受到样本状态、⽂库质(zhì)量和定量准确性等因素的影响而发生变化。
• Balanced Mode是平衡数据质(zhì)量和芯片利用(yòng)率的最优解。在该模式下，我们统计了近3个⽉，SURFSeq 5000FCH芯片7大类应用(yòng)方向共116轮的测试数据。其中(zhōng)100轮Balanced Mode PE150测序数据的Q30、Q40均值达分(fēn)别达到了95.1%和91.3%，Output reads均值达到了2500M reads(官标2000M reads)。
• 全新(xīn)的Enhanced Mode在Balanced Mode的基础上，加入了基于机器學(xué)习构建的序列特征模型等多(duō)维信息，全新(xīn)的“3D Basecall”可(kě)更全面的识别测序过程中(zhōng)的“问题序列區(qū)域”，并更准确地进行碱基识别和Q值打分(fēn)。统计16轮Enhanced Mode下WGS PE150测序数据，Q30、Q40均值达分(fēn)别达到了97.1%和95.2%，Output reads均值达到了2350M reads。
*在数据产(chǎn)量Output reads方面，Enhanced Mode相比Balanced Mode会有(yǒu)5%±2%水平的降低(该差异水平依据為(wèi)“对相同原始图像分(fēn)别使用(yòng)两种模式下basecall算法获得的数据差值”)，降低比例受到样本状态、文(wén)库构建方式及质(zhì)量和文(wén)库定量精(jīng)准度等因素影响。