QIAGEN选用(yòng)QIAseq Targeted DNA Panel基于真迈生物(wù)测序平台进行测试,测试结果显示On target rate 90%,均一性表现佳,突变位点均可(kě)检出,真迈生物(wù)两个测序平台VAF(%) 突变的检出结果也具(jù)有(yǒu)很(hěn)高的一致性。扩增子文(wén)库中(zhōng)的common sequence區(qū)域测序质(zhì)量符合预期。
SURFSeq 5000与GenoLab M VAF(%) 相关性比较
真迈生物(wù)SURFSeq 5000测试质(zhì)量Q40数据已达到90%,错误率低至万分(fēn)之五(0.05%),数据质(zhì)量业界领先,且测序成本更低,和行业同级别测序仪相比具(jù)有(yǒu)显著优势;GenoLab M数据质(zhì)量优异,通量灵活(18Gb-300Gb),用(yòng)户可(kě)根据相关应用(yòng)场景自由选择合适通量。
QIAGEN SPE(基于单端特异性引物(wù)延伸技(jì )术)靶向测序方案技(jì )术能(néng)够实现在一个反应管中(zhōng)最多(duō)兼容2万条特异性引物(wù)的PCR反应,而特异性依旧可(kě)高达90%以上。仅需一条引物(wù)结合到靶向區(qū)域即可(kě)扩增,整體(tǐ)扩增均一性指标 (Uniformity) 超过97%。
QIAseq FX DNA Library Kit制备的WGS文(wén)库基于真迈生物(wù)测序平台测序的覆盖度、均一度等指标与其他(tā)主流平台相当。QIAseq FX支持20 pg-1 μg的广泛样本起始量,无需片段化和接头连接反应之间进行纯化,能(néng)够不受基因序列影响,制备出具(jù)有(yǒu)最低G/C偏好性的基因文(wén)库,特别适用(yòng)于具(jù)有(yǒu)高度复杂性的各种基因组。
真迈测序平台检测Small RNA的性能(néng)表现一致
Small RNA文(wén)库仅需SE75即可(kě)完成测序,但是考虑测序成本和便利性,一般选用(yòng)PE150上机。本次测试选择了PE150的测序方案,数据则截取R1 75bp进行分(fēn)析,测试结果显示真迈生物(wù)测序平台miRNA检出比例与其他(tā)主流平台高度一致,在真迈生物(wù)不同测序平台间,miRNA检出比例与表达量仍具(jù)有(yǒu)较高的一致性。
SURFSeq 5000与GenoLab M 检测miRNA的一致性比较
QIAseq miRNA Library Kit 是一款专為(wèi)miRNA等小(xiǎo)RNA测序分(fēn)析设计的NGS解决方案,独特的寡核苷酸处理(lǐ)技(jì )术极大程度降低了文(wén)库构建过程中(zhōng)接头二聚體(tǐ)及其他(tā)“污染性”RNA(如hY4 RNA)的存在,无需凝胶電(diàn)泳、割胶以及回收等一系列繁琐步骤,最低起始量仅需1ng总RNA。
基于QIAGEN CLC Genomics Workbench Premium的LightSpeed模块,可(kě)助力真迈生物(wù)相关用(yòng)户以更短的运行时间进行高性价比的全基因组测序(WGS)二级分(fēn)析。QCI Interpret是一个完全可(kě)定制的变异解读方案,為(wèi)肿瘤和遗传病应用(yòng)NGS检测的变异进行注释和评级,目前已解读超过300万份报告。
QIAGEN生物(wù)信息解读完整方案
此次合作(zuò)测试,真迈生物(wù)测序平台与QIAGEN试剂盒表现出高度的适配性。未来,真迈生物(wù)与QIAGEN将深化合作(zuò),发挥双方在高通量基因测序领域的优势,為(wèi)全球临床及科(kē)研用(yòng)户提供精(jīng)准高效的测序平台、生物(wù)试剂,以及强大的数据分(fēn)析与解读系统,持续拓宽测序应用(yòng)场景,為(wèi)前沿科(kē)研探索和精(jīng)准医(yī)疗提供强大支持,共同促进产(chǎn)业创新(xīn)发展。
*真迈生物(wù)基因测序平台
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